Bayanlarda çeyrek final karşılaşmaları iki maç üzerinden oynayacak. İlk maç 15-17 Ocak 2013 tarihinde yapılacak. Rövanş karşılaşmaları ise 28-29 Ocak 2013 tarihinde oynanacak.
Erkeklerde Türkiye Kupası 2. Tur müsabakaları tek maç eleme usulü ile gerçekleştirilecek. Karşılaşmalar 26-28 Aralık'ta yapılacak.
Hentbol Federasyonu Genel Sekreteri Mutlu Kadıoğlu, kura çekimi öncesi yaptığı konuşmada tur atlayan takımları tebrik ederken, kura çekimine katılan kulüplere başarılar diledi. Daha sonra kura çekimlerine geçildi. İlk önce Bayanlar Türkiye Kupası Çeyrek Final müsabakalarının kuraları çekildi.
Çekilen kura sonunda Bayanlar Türkiye Kupası Çeyrek Final Müsabakalarında şu takımlar, birbirleriyle eşleşti:
Çankaya Belediyesi ANKA-Ardeşen Gençlik Spor Kulübü, Üsküdar Belediyesi Spor Kulübü-Orduspor Kulübü, Yenimahalle Belediyesi Spor Kulübü- Muratpaşa Belediye Spor Kulübü, Anadolu Üniversitesi Spor Kulübü- Maltepe Belediyesi Spor Kulübü.
Erkekler Türkiye Kupası 2. Tur eşleşmeler:
İzmir Büyükşehir Belediyesi Spor Kulübü-Maliye Milli Piyango Spor Kulübü, Göztepe Spor Kulübü- Ankara İl Özel İdaresi Spor Kulübü, Mersin Hentbol Spor Kulübü-Yıldız Teknik Üniversitesi Spor Kulübü, Sinop Eğitim Spor Kulübü-Yeditepe Spor Kulübü, Antalya Spor Kulübü-Çankaya Belediyesi ANKA Spor Kulübü, Trabzon Spor Kulübü-Büyükşehir Belediye Ankara Spor Kulübü, Nilüfer Belediyesi Spor Kulübü-Beşiktaş, Selçuklu Belediyesi Spor Kulübü-Kayseri Atlas Eğitim Spor Kulübü.